Кукша — обитатель северных таежных лесов. В зимнее время регулярно встречалась только в подзоне северной тайги — от Лапландии и Карелии до востока Коми (в среднем за период учетов обилие в лесах примерно 1–2 ос. на 1 кв. км) и на западе средней тайги (заповедник «Кивач», около 0,5 ос.). На остальной территории средней тайги и в восточной половине южной тайги встречи были единичны, обилие не превышало 0,09 ос. на 1 кв. км. На западе южной тайги единично отмечена только в Ленинградской области. К югу от таежной зоны в зимних учетах единичные встречи зарегистрированы в Подмосковье (в Талдомском р-не в 1970-х гг.), в респ. Марий Эл (заповедник «Большая Кокшага, 2011 и 2013 г.), в Удмуртии (1988 и 1990 г). На Урале, включая его северную таежную часть, встречи также редки, обилие на модельных территориях в среднем по годам было меньше 0,1 ос. на 1 кв. км.
Сокращение ареала и снижение численности кукши на европейской территории отмечают с конца XIX в. (Атлас гнездящихся птиц Европейской России, 2020). Данные зимних учетов позволяют предполагать, что в 1980–1990-х годах численность была выше, чем в последние два десятилетия. По результатам экстраполяции на основе данных зимних учетов, на территории мониторинга насчитывалось в 1988–2000 гг. в среднем приблизительно 350–400 тыс. ос., в 2001–2011 г. и в 2012–2023 гг. — 100–150 тыс. ос.