Гнездовой ареал сойки охватывает большую часть территории Европейской России; отсутствует только на северо-востоке от южных границ северной тайги, и на юго-востоке, на обширных степных участках северного Прикаспия и Калмыкии. Зимой встречается по всей территории мониторинга, на большей её части обычна, малочисленна только в подзоне северной тайги — здесь в среднем по годам показатели обилия в лесах меньше 0,1 ос. на 1 кв. км, на ряде территорий в учетах не отмечена. В подзоне средней тайги обилие в лесах составляло 0,1–0,5 ос. на 1 кв. км, в южной тайге — 0,2–1,2 ос. В обеих подзонах плотность населения к востоку уменьшалась. В южной части лесной зоны Восточноевропейской равнины, в подтаежных лесах и лесостепи показатели составляли 1,5–4 ос., локально доходя до 8–10 ос. На Урале значения немного ниже — 0,7–1 ос. Существенных различий по среднему обилию в разных типах лесных местообитаний не выявлено, при этом биотопическое распределение менялось от года к году. В некоторых регионах сойки отдавали предпочтение пойменным широколиственным и ольховым лесам, избегая лесов на междуречьях с преобладанием липы и мелколиственных пород (березы, осины).
В настоящее время по данным мониторинга мы не можем с уверенность заключить, оставалась ли численность сойки за последние десятилетия стабильной или же немного увеличилась. Признаки роста обилия в разные периоды отмечены на северных модельных территориях — в зонах тайги и хвойно-широколиственных лесов; в других регионах показатели в среднем не изменились.
В зимнее время сойки часто держатся не только в лесах, но и в нелесных биотопах — полях и лугах с лесополосами и перелесками, сельских населенных пунктах. Показатели обилия в нелесных местообитаниях на разных модельных территориях очень сильно варьируют в зависимости от конкретных особенностей биотопов. В целом можно отметить, что там, где леса преобладают по площади, плотность населения соек в полях и лугах-перелесках незначительно отличается от лесной. В южных регионах, где полей намного больше чем лесов, плотность населения соек в открытых биотопах в среднем в 2–2,5 раза ниже, чем в лесах. В деревнях и поселках сельского типа плотность обычно не меньше лесной, а местами заметно выше. Кое-где средние значения доходят до 8–12 ос. на 1 кв. км. В городах на застроенных территориях соек нет или они встречаются единично, но часто обитают в парках, лесопарках и пригородных лесах, где есть кормушки, доступны пищевые отходы и т.п. В таких биотопах обилие бывает заметно больше, чем в лесных массивах вдали от населенных пунктов. Более чем на половине модельных территорий в нелесных местообитаниях отмечалось увеличение показателей обилия соек за период наблюдений.
По данным, собранным при подготовке «Атласа гнездящихся птиц Европейской России», в 2010–2018 годах на охваченной территории гнездилось от 1 до 2 млн. пар. Сходный уровень численности — в среднем около 2,9 млн. ос. — получен для лесной зоны по данным 30–40-летней давности (Е.С. Равкин, Ю.С. Равкин, 2005). Показатели, полученные по результатам экстраполяции на основе данных зимних учетов, несколько ниже: в лесах Европейской России (без Кавказа) в 1988–2023 г. насчитывалось приблизительно 500–650 тыс. ос. Учитывая, что сойки зимой держатся не только в лесах, их зимнюю численность на территории мониторинга можно приблизительно оценить в 1–1,5 млн. ос.
