В Европейской России пищуха встречается практически везде, где есть лесная растительность. На юге ареала обитает круглогодично, с севера таежной зоны большая часть особей на зиму откочевывает. В северной тайге пищуха малочисленна, она избегает обширных таежных водоразделов и в основном придерживается лесов в речных долинах. Часть птиц, видимо, держится круглый год на постоянных территориях, для других характерны послегнездовые и весенние кочевки с периодом территориальности зимой и в гнездовое время. Пищухи никогда не образуют больших скоплений, вне сезона гнездования встречаются по 1–2, редко до 4 особей, часто присоединяются к смешанным «синичьим» стаям.
В способе добычи корма в зимнее время пищухи очень специализированы — они извлекают беспозвоночных из трещин коры на стволах, реже на толстых ветвях деревьев. Обитают в различных лесах, чаще с взрослым и старовозрастным древостоем. В таежной зоне предпочитают хвойно-лиственные и сосновые, в меньшей степени еловые леса; чаще встречаются по приручьевым лощинам и склонам речных долин. На юге лесной зоны чаще селятся в смешанных, широколиственных лесах и сосняках. Избегают молодняков и лесов с преобладанием березы и осины. Во время кочевок могут встречаться в нехарактерных местообитаниях: небольших фрагментах древесной и кустарниковой растительности среди открытых пространств, на застроенных территориях. Показатели обилия увеличиваются к югу и западу лесной зоны.
На большей части южной тайги, подтаежных и широколиственных лесов, в лесных массивах лесостепи, а также в западной части среднетаежной подзоны пищуха входит в число обычных видов: показатели обилия в среднем по различным лесам составляют от 1 до 10 ос./км2. Значительные межгодовые колебания численности для нее не характерны.
Данные программы «Parus» показывают, что тренд динамики зимней численности в целом для территории Европейской России можно оценить как умеренное снижение. Наиболее заметным оно было в последнее десятилетие; ранее численность поддерживалась на более или менее постоянном уровне. По данным о плотности населения птиц и площади лесных местообитаний, зимняя численность пищух на территории Европейской России (без Кавказа) в 2010–2020 гг. составляла примерно 1,9 млн. особей, в предыдущие два десятилетия — 2,4–2,7 млн.
Гнездовая численность по материалам, собранным в процессе подготовки «Атласа гнездящихся птиц Европейской России» в последние полтора десятилетия оценивается в интервале 1–2 млн. пар. Сравнение этих показателей с расчетами, сделанными на основе учетов в середине и второй половине XX в., свидетельствует о том, что в период гнездования пищух, возможно, также стало меньше.